| 隠しユニット＆キャラ＆武器名 | 入手方法 |
| バストール＆ガラリア | 7話から選択可能な「東京」で、ガラリア以外の敵を倒してからショウでガラリアを説得する。 |
| ギャプラン＆ロザミィ | 11話「二人のニュータイプ」で、ロザミィをカミーユで説得する。 |
| ダンバイン＆トッド | 13話から選択可能な「ニューヨーク」でショウでトッドを説得し撃墜する。 |
| ケンプファー | 13話から選択可能な「中央アジア砂漠地帯」を2,3番目に選択するとクリア後にもらえる。ただし、シローがいる時じゃないともらえません。 |
| ライネック | バイストンウェルルートの20話「ドレイク城」で、バーンを倒すと出てくるコンテナの中に入っている。 |
| 量産型グレートマジンガー | 最初の選択肢で「科学要塞研究所」を最後に行き、鉄也を地上に残す。17話「絶対零度の罠」で量産型グレートマジンガーを鉄也で説得する。 |
| アプサラスU＆アイナ | 13話から選択可能な「東南アジアジオン秘密基地」でシローでアイナ(アプサラスU)を撃墜する。21話で増援として出てくるアイナをシローで説得する。 |
| グフカスタム＆ノリス | 21話でアイナを説得後、アイナ、バーニィの順で説得する。 |
| キュベレイmk-U＆プル | 13話から選択可能な「中央アジア砂漠地帯」で5ターンまでにピラミッドを全て破壊する。その後でてくるプルを撃墜する。第2部の後半で仲間になる。 |
| G-3ガンダム | 23話から選択可能な「無人島」で、ベンメルを敵10ターンまで生かしておくとG−3ガンダムが出てくるのでクリスで撃墜する。 |
| シャア専用ザク | 23話から選択可能な「無人島」で、ベンメルを敵10ターンまで生かしておくとシャア専用ザクが出てくるのでバーニィで撃墜する。 |
| テキサスマック＆ジャック、メリー | 23話から選択可能な「早乙女研究所」を1,2番目に選ぶ。 |
| サイコガンダム | 29話からの選択肢を「ジャブロー東」「ジャブロー西」の順で進むと、サイコガンダムが出てくるのでカミーユで撃墜する。 |
| ガンダム | 33話でマップ隅のコンテナに入っている。熟練度関係？ |
| ジム・キャノンU | 33話で隠し部屋(デビルガンダムの近く)の中のコンテナに入っている。 |
| ガンダムシュピーゲル＆シュバルツ | 33話でシュバルツのＨＰが一度も50％以下にならないこと。 |
| マスターガンダム＆東方不敗 | マスターガンダムをドモン以外で撃墜する。するとラー・カイラム隊ルート(ムーン編)で選択選択可能な「ネオジャパンコロニー」でデビルガンダム撃墜後、仲間になる。 |
| リックディアス | 40話でコンテナの中に入っている |
| アイザム・ザ・サード＆シャザーラ | 45話から選択可能な「コロニー帯」で、シャザーラのHPを半分以下にし、ダンガイオーで説得、その後シャザーラのHPを30%以下にし、もう一度ダンガイオーで説得。 |
| コア・ブースター | 51話から選択可能な「ゼダンの門内部」の中央の隠し部屋のコンテナ。 |
| ヴァル・ヴァロ | 55話でケリィを撃墜するとでてくるコンテナに入っている。 |
| キュベレイmk-U＆プルツー | 57話から選択可能な「ルナツー内部」でプルツーをジュドーで説得し、HPを30％未満にしてからもう一度ジュドーで説得。 |
| ジェガン | 57話から選択可能な「ルナツー内部」で、隠し部屋のコンテナ。 |
| 百式改orフルアーマー百式改 | 63話より選択可能な「ソロモン内部」で扉付き部屋のコンテナに入っている。熟練度が30以上だと百式改、29以下だとフルアーマー百式改。 ただし、13話より選択可能な「東南アジアジオン秘密基地」でガトーを撃墜してること。 |
| Ｘエステバリス改orＺU | 63話から選択可能な「メガノイド空間」を1,2番目に選択するとＸエステバリス改、3,4番目に選択するとＺUを入手。 |
| ジンギmk-U＆キナ＆コロン | 57話から選択可能な「廃棄コロニー帯」でキナをロムで説得、67話でディオンドラ撃墜後にロムでキナを説得する。 |
| 夜間迷彩ビルバイン | 72話で入手。 ただし、第１部でビルバインを入手していること。 |
| 真・ゲッター | 73話から選択可能な「早乙女研究所」で研究所に敵を侵入させると、75話にて入手。 |
| ズワァース | 77話でミュージィを撃墜するとでてくるコンテナに入っている。 |
| ライン・ヴァイスリッター | 73話から選択可能な「早乙女研究所」で研究所に敵を侵入させずにエクセレン以外の敵を全滅後、キョウスケで説得。77話でエクセレン以外の敵全滅後HPを減らして撤退させる。78話からの分岐でラー・カイラム隊ルート(ムーン編)で選択可能な「月近海・暗礁空域」でアルフィミィ撤退後、エクセレンをキョウスケで撃墜する。 |
| νガンダムor νガンダムHWS | 78話からの分岐でラー・カイラム隊ルート(ムーン編)で入手。熟練度が総クリアステージ数の半分未満の場合はνガンダムHWS、半分以上の場合はνガンダム。 |
| グローバイン | 51話から選択可能な「巨石群」で3ターン以内にグローバインのHPを50％以下にする。78話からの分岐でラー・カイラム隊ルート(ムーン編)で選択可能な「テキサスコロニー」でグローバインをジェットで説得する。 ただし、ムーン編をアース編より先に選ぶこと。 |
| キリカ | 78話からの分岐でラー・カイラム隊ルート(ムーン編)のラストでキリカをマリアで説得する。 |
| ノイエ・ジール＆ガトー | 55話でコウとガトーの戦闘後にクワトロで説得。80話より選択可能な「フィフス・ルナ」でクワトロで説得後にグレミーとハマーンを撃墜後、コウで説得。 |
| キュベレイ | 80話より選択可能な「フィフス・ルナ」でハマーンを撃墜するとでてくるコンテナに入っている。 |
| ザクV改 | 80話より選択可能な「フィフス・ルナ」でマシュマーを撃墜するとでてくるコンテナに入っている。 |
| クイン・マンサ | 80話より選択可能な「フィフス・ルナ」でグレミーを撃墜するとでてくるコンテナに入っている。 |
| ガルディ | 94話でロムで説得後、レイナで説得。 |
| ガンダム試作2号機 | 13話より選択可能「東南アジアジオン秘密基地」でアイナをシローで撃墜。95話でガンダム試作2号機をシローで撃墜する。 |
| 零影＆イルボラ | 69話から選択可能な「ディラド星南部」でイルボラのHPを30％未満にし、ジョウで説得。78話からの分岐でナデシコ隊ルート(マーズ編)で選択可能な「火星開拓基地」でシャルムを撃墜後、イルボラをジョウで説得。95話でイルボラをロミナで説得後、ジョウで撃墜。 |
| ダイテツジン＆九十九 | 95話で10ターン以内に敵を全滅する。 |
| アルフィミィ | 99話にてアルフィミィを倒すと仲間になる。 |
| スパイラルナックル(ダンガイオー) | 45話から選択可能な「コロニー帯」で一度シャザーラを説得、ダンガイオーで止めを刺すとスパイラルナックルが使用可能になる。 |
| アグレッシブビーストモード(ダンクーガ) | 5話終了までにダンクーガの武器とステータスを1段階以上改造すると、第2部で早めに習得できる。改造してなくても第3部で必ず覚える。 |
| 断空光我剣(ダンクーガ) | 78話からの分岐でガンドール隊ルート(アース編)の「獣戦機隊基地」でダンクーガのＨＰが30％以下でシャピロと忍が戦闘、双方が生きていると使用可能になる。 |
| ゴッドボイス(ライディーン) | 78話からの分岐でガンドール隊ルート(アース編)で「ムートロン遺跡」でライディーンで激怒を撃墜後、「妖魔の島」で、豪雷をライディーンで撃墜、妖魔巨烈バラゴーンもライディーンで撃墜、ゴッドボイスが使用可能になる。 |
| 石覇ラブラブ天驚拳 | 90話で出てくるデビルガンダム最終形態を、ドモンで説得すると使用可能になる。 |